Dirangkum dari berbagai sumber, Ustaz Yahya sempat menjabat sebagai Ketua atau Rektor Sekolah Tinggi Theologia (STT) Calvinis Ebenhaezer di Sorong pada tahun 1997-2004. Selain itu, ia juga pernah menjabat sebagai salah satu anggota DPRD di Sulawesi Utara.
Pada 2006, Yahya Waloni juga pernah menjadi dosen di Universitas Balikpapan (Uniba). Pada tahun yang sama, ia pindah ke Kota Cengkeh, Tolitoli, dan mendapatkan bimbingan dari Ketua Majelis Ulama Indonesia (MUI). (*/adji/cr09/ys)
