Namun, Muktamar NU kembali diadakan kembali pasca kemederkaan Indonesia pada tahun 1946 bertempat di Purwokerto.
Biasanya, Muktamar NU dihadiri oleh Pengurus Besar Nahdlatu Ulama (PBNU), Pengurus Wilayah Nahdlatul Ulama (PWNU) dan Pengurus Cabang Nahdlatul Ulama (PCNU).
Pagelaran Muktamar NU pun dari tahun ke tahu semakin meriah, karena banyak dihadiri oleh ulama besar, tokoh masyarakat hingga petinggi negara (Rizanatul Fitri)
